Naja, IMHO muss eine wirklich GRÜNDLICHE Defragmentierung unter Windows unter einem anderen Betriebssystem erfolgen, also sprich: Die aktuell aktive Win-Partition zu defragmentieren bringt recht wenig, weil die ganzen Dateien alle in Benutzung sind und somit gesperrt sind. Recht gut funktioniert's allerdings wenn man das von einem anderen Win aus macht, z.B. ein Parallel installiertes Not-System oder so...
Das mit der Auslagerungsdatei: am besten sowieso auf eine andere Partition, möglichst eine andere Festplatte legen. Wenn sie dich beim Defragmentieren stört kannst du sie vorübergehend auch mal auf null setzen - mag Windows zwar nicht, funktioniert aber durchaus problemlos, ich hab auf meinem P3 mit 3*128mb ram ohne Auslagerungdatei auch schon auf Lans Renegade gezockt
Allerdings: Ob es sich lohnt dafür dreimal neu zu starten bezweifle ich